Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms