Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A3P57103 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A3P57103 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A3P57103 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A3P57103 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A3P57103 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A3P57103 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC8A3P57103 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A3P57103 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A3P57103 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A3P57103 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A3P57103 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC8A3P57103 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC8A3P57103 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC8A3P57103 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC8A3P57103 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC8A3P57103 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC8A3P57103 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms