Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTBP2P56545 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTBP2P56545 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTBP2P56545 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms