Protein–RNA interactions for Protein: P56134

ATP5J2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5J2P56134 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5J2P56134 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5J2P56134 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5J2P56134 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5J2P56134 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5J2P56134 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5J2P56134 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5J2P56134 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5J2P56134 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP5J2P56134 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5J2P56134 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5J2P56134 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5J2P56134 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5J2P56134 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5J2P56134 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5J2P56134 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5J2P56134 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5J2P56134 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5J2P56134 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms