Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OXCT1P55809 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OXCT1P55809 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OXCT1P55809 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OXCT1P55809 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OXCT1P55809 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms