Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCL23P55773 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCL23P55773 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCL23P55773 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCL23P55773 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCL23P55773 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCL23P55773 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCL23P55773 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCL23P55773 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCL23P55773 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCL23P55773 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCL23P55773 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCL23P55773 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCL23P55773 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCL23P55773 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCL23P55773 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCL23P55773 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCL23P55773 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCL23P55773 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCL23P55773 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCL23P55773 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCL23P55773 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL23P55773 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL23P55773 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCL23P55773 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCL23P55773 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCL23P55773 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCL23P55773 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCL23P55773 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL23P55773 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCL23P55773 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCL23P55773 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCL23P55773 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL23P55773 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL23P55773 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL23P55773 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL23P55773 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL23P55773 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL23P55773 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL23P55773 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL23P55773 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL23P55773 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL23P55773 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL23P55773 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCL23P55773 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCL23P55773 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCL23P55773 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL23P55773 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL23P55773 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL23P55773 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL23P55773 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL23P55773 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL23P55773 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL23P55773 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL23P55773 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL23P55773 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL23P55773 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL23P55773 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL23P55773 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL23P55773 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL23P55773 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL23P55773 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL23P55773 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL23P55773 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL23P55773 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL23P55773 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL23P55773 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL23P55773 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL23P55773 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL23P55773 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL23P55773 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL23P55773 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL23P55773 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL23P55773 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL23P55773 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL23P55773 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL23P55773 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCL23P55773 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCL23P55773 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCL23P55773 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCL23P55773 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCL23P55773 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCL23P55773 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCL23P55773 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCL23P55773 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL23P55773 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL23P55773 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL23P55773 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL23P55773 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL23P55773 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCL23P55773 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCL23P55773 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCL23P55773 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL23P55773 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL23P55773 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL23P55773 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL23P55773 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL23P55773 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL23P55773 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCL23P55773 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms