Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP9P55211 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP9P55211 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP9P55211 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP9P55211 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP9P55211 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP9P55211 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP9P55211 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP9P55211 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP9P55211 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP9P55211 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP9P55211 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP9P55211 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP9P55211 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP9P55211 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP9P55211 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP9P55211 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP9P55211 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP9P55211 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP9P55211 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP9P55211 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP9P55211 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP9P55211 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP9P55211 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP9P55211 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP9P55211 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP9P55211 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP9P55211 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP9P55211 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP9P55211 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP9P55211 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP9P55211 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP9P55211 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP9P55211 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP9P55211 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP9P55211 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP9P55211 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP9P55211 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP9P55211 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP9P55211 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP9P55211 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP9P55211 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP9P55211 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP9P55211 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP9P55211 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP9P55211 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP9P55211 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP9P55211 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP9P55211 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP9P55211 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP9P55211 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP9P55211 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP9P55211 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP9P55211 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP9P55211 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP9P55211 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP9P55211 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP9P55211 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP9P55211 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP9P55211 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP9P55211 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP9P55211 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP9P55211 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP9P55211 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP9P55211 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP9P55211 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP9P55211 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP9P55211 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP9P55211 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP9P55211 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP9P55211 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP9P55211 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP9P55211 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP9P55211 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP9P55211 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP9P55211 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP9P55211 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP9P55211 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP9P55211 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP9P55211 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP9P55211 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP9P55211 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP9P55211 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP9P55211 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP9P55211 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP9P55211 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP9P55211 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP9P55211 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP9P55211 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP9P55211 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP9P55211 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP9P55211 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP9P55211 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP9P55211 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP9P55211 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP9P55211 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP9P55211 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP9P55211 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP9P55211 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP9P55211 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms