Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP12AP54707 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP12AP54707 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP12AP54707 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP12AP54707 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms