Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUCLG1P53597 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLG1P53597 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUCLG1P53597 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms