Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUBP1P53384 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUBP1P53384 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUBP1P53384 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUBP1P53384 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUBP1P53384 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUBP1P53384 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms