Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDR1P51861 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDR1P51861 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDR1P51861 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDR1P51861 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDR1P51861 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDR1P51861 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDR1P51861 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDR1P51861 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDR1P51861 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDR1P51861 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDR1P51861 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDR1P51861 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDR1P51861 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDR1P51861 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDR1P51861 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDR1P51861 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDR1P51861 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDR1P51861 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDR1P51861 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDR1P51861 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDR1P51861 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDR1P51861 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDR1P51861 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDR1P51861 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDR1P51861 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDR1P51861 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDR1P51861 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDR1P51861 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDR1P51861 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDR1P51861 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDR1P51861 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDR1P51861 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDR1P51861 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDR1P51861 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDR1P51861 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDR1P51861 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDR1P51861 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDR1P51861 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDR1P51861 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDR1P51861 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDR1P51861 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDR1P51861 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDR1P51861 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDR1P51861 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDR1P51861 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDR1P51861 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDR1P51861 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDR1P51861 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDR1P51861 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDR1P51861 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDR1P51861 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDR1P51861 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDR1P51861 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDR1P51861 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDR1P51861 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDR1P51861 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDR1P51861 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDR1P51861 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDR1P51861 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDR1P51861 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDR1P51861 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDR1P51861 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDR1P51861 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDR1P51861 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDR1P51861 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDR1P51861 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDR1P51861 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDR1P51861 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDR1P51861 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDR1P51861 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDR1P51861 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDR1P51861 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDR1P51861 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDR1P51861 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDR1P51861 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDR1P51861 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDR1P51861 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDR1P51861 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDR1P51861 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDR1P51861 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDR1P51861 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDR1P51861 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDR1P51861 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDR1P51861 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDR1P51861 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDR1P51861 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDR1P51861 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDR1P51861 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDR1P51861 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDR1P51861 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDR1P51861 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDR1P51861 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDR1P51861 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDR1P51861 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDR1P51861 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDR1P51861 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDR1P51861 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDR1P51861 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDR1P51861 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms