Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPC3P51654 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPC3P51654 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPC3P51654 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPC3P51654 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPC3P51654 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GPC3P51654 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPC3P51654 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPC3P51654 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPC3P51654 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPC3P51654 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPC3P51654 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC3P51654 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPC3P51654 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPC3P51654 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC3P51654 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC3P51654 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC3P51654 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPC3P51654 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC3P51654 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC3P51654 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPC3P51654 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GPC3P51654 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPC3P51654 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPC3P51654 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPC3P51654 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GPC3P51654 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPC3P51654 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPC3P51654 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPC3P51654 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPC3P51654 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPC3P51654 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPC3P51654 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPC3P51654 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC3P51654 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC3P51654 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC3P51654 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC3P51654 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPC3P51654 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPC3P51654 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPC3P51654 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPC3P51654 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPC3P51654 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPC3P51654 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPC3P51654 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GPC3P51654 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPC3P51654 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPC3P51654 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GPC3P51654 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPC3P51654 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPC3P51654 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPC3P51654 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPC3P51654 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPC3P51654 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPC3P51654 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPC3P51654 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPC3P51654 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPC3P51654 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPC3P51654 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPC3P51654 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPC3P51654 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPC3P51654 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPC3P51654 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPC3P51654 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPC3P51654 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPC3P51654 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPC3P51654 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPC3P51654 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPC3P51654 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPC3P51654 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPC3P51654 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPC3P51654 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPC3P51654 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPC3P51654 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPC3P51654 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC3P51654 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC3P51654 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPC3P51654 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPC3P51654 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPC3P51654 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPC3P51654 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPC3P51654 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPC3P51654 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPC3P51654 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPC3P51654 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms