Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.52■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
SMARCA2P51531 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
SMARCA2P51531 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
SMARCA2P51531 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
SMARCA2P51531 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
SMARCA2P51531 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
SMARCA2P51531 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
SMARCA2P51531 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
SMARCA2P51531 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
SMARCA2P51531 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
SMARCA2P51531 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
SMARCA2P51531 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
SMARCA2P51531 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
SMARCA2P51531 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
SMARCA2P51531 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
SMARCA2P51531 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
SMARCA2P51531 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
SMARCA2P51531 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC47.36■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.34■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC47.34■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA2P51531 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.28■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
SMARCA2P51531 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
SMARCA2P51531 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
SMARCA2P51531 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
SMARCA2P51531 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC47.14■■■■■ 5.14
SMARCA2P51531 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
SMARCA2P51531 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.14
SMARCA2P51531 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
SMARCA2P51531 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.11■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC47.09■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
SMARCA2P51531 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC47.07■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC47.07■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC47.04■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
SMARCA2P51531 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms