Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF10P50591 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF10P50591 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF10P50591 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF10P50591 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFSF10P50591 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF10P50591 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF10P50591 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF10P50591 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms