Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EMDP50402 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMDP50402 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMDP50402 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMDP50402 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMDP50402 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMDP50402 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMDP50402 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMDP50402 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EMDP50402 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMDP50402 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMDP50402 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMDP50402 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMDP50402 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMDP50402 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMDP50402 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMDP50402 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EMDP50402 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMDP50402 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMDP50402 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMDP50402 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMDP50402 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMDP50402 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMDP50402 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMDP50402 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMDP50402 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMDP50402 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMDP50402 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMDP50402 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMDP50402 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMDP50402 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMDP50402 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMDP50402 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMDP50402 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMDP50402 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EMDP50402 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMDP50402 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMDP50402 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMDP50402 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMDP50402 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMDP50402 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMDP50402 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMDP50402 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMDP50402 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMDP50402 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMDP50402 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMDP50402 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMDP50402 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMDP50402 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMDP50402 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMDP50402 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMDP50402 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMDP50402 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMDP50402 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMDP50402 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMDP50402 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMDP50402 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EMDP50402 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMDP50402 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMDP50402 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMDP50402 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMDP50402 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EMDP50402 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMDP50402 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EMDP50402 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EMDP50402 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMDP50402 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMDP50402 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMDP50402 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMDP50402 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMDP50402 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EMDP50402 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMDP50402 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMDP50402 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMDP50402 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMDP50402 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMDP50402 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMDP50402 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMDP50402 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMDP50402 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMDP50402 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMDP50402 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMDP50402 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMDP50402 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMDP50402 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMDP50402 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMDP50402 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMDP50402 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMDP50402 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMDP50402 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMDP50402 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMDP50402 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMDP50402 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMDP50402 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMDP50402 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMDP50402 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMDP50402 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMDP50402 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMDP50402 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMDP50402 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms