Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
UTRNP46939 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
UTRNP46939 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
UTRNP46939 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
UTRNP46939 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
UTRNP46939 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
UTRNP46939 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
UTRNP46939 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
UTRNP46939 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
UTRNP46939 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
UTRNP46939 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
UTRNP46939 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
UTRNP46939 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
UTRNP46939 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
UTRNP46939 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
UTRNP46939 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
UTRNP46939 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
UTRNP46939 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
UTRNP46939 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
UTRNP46939 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
UTRNP46939 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
UTRNP46939 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
UTRNP46939 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
UTRNP46939 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UTRNP46939 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
UTRNP46939 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
UTRNP46939 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
UTRNP46939 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
UTRNP46939 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UTRNP46939 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UTRNP46939 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
UTRNP46939 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UTRNP46939 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
UTRNP46939 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
UTRNP46939 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
UTRNP46939 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
UTRNP46939 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
UTRNP46939 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
UTRNP46939 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
UTRNP46939 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
UTRNP46939 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
UTRNP46939 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
UTRNP46939 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
UTRNP46939 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
UTRNP46939 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
UTRNP46939 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
UTRNP46939 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
UTRNP46939 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
UTRNP46939 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
UTRNP46939 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
UTRNP46939 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
UTRNP46939 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
UTRNP46939 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
UTRNP46939 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
UTRNP46939 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UTRNP46939 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UTRNP46939 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
UTRNP46939 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
UTRNP46939 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UTRNP46939 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
UTRNP46939 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UTRNP46939 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
UTRNP46939 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UTRNP46939 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UTRNP46939 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
UTRNP46939 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
UTRNP46939 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
UTRNP46939 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
UTRNP46939 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
UTRNP46939 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
UTRNP46939 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
UTRNP46939 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
UTRNP46939 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
UTRNP46939 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
UTRNP46939 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
UTRNP46939 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
UTRNP46939 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UTRNP46939 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UTRNP46939 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
UTRNP46939 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
UTRNP46939 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
UTRNP46939 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
UTRNP46939 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
UTRNP46939 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
UTRNP46939 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
UTRNP46939 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
UTRNP46939 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
UTRNP46939 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
UTRNP46939 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UTRNP46939 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
UTRNP46939 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
UTRNP46939 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
UTRNP46939 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UTRNP46939 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UTRNP46939 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UTRNP46939 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UTRNP46939 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UTRNP46939 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
UTRNP46939 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
UTRNP46939 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms