Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRCC3P46736 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRCC3P46736 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRCC3P46736 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRCC3P46736 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRCC3P46736 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms