Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN1BP46527 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN1BP46527 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKN1BP46527 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN1BP46527 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms