Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRXP46100 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRXP46100 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRXP46100 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRXP46100 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRXP46100 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRXP46100 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRXP46100 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRXP46100 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRXP46100 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATRXP46100 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRXP46100 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRXP46100 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRXP46100 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRXP46100 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRXP46100 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRXP46100 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRXP46100 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRXP46100 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRXP46100 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRXP46100 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRXP46100 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRXP46100 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRXP46100 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATRXP46100 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRXP46100 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRXP46100 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRXP46100 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRXP46100 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRXP46100 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRXP46100 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRXP46100 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRXP46100 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRXP46100 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRXP46100 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRXP46100 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRXP46100 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRXP46100 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRXP46100 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRXP46100 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRXP46100 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRXP46100 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRXP46100 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRXP46100 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRXP46100 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRXP46100 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRXP46100 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRXP46100 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRXP46100 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRXP46100 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRXP46100 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRXP46100 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRXP46100 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRXP46100 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRXP46100 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRXP46100 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRXP46100 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRXP46100 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRXP46100 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRXP46100 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRXP46100 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRXP46100 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRXP46100 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRXP46100 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRXP46100 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRXP46100 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRXP46100 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRXP46100 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRXP46100 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRXP46100 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRXP46100 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRXP46100 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRXP46100 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRXP46100 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATRXP46100 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRXP46100 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRXP46100 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRXP46100 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRXP46100 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRXP46100 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRXP46100 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRXP46100 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRXP46100 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRXP46100 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRXP46100 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRXP46100 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRXP46100 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRXP46100 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRXP46100 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRXP46100 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATRXP46100 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATRXP46100 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRXP46100 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRXP46100 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRXP46100 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRXP46100 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRXP46100 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRXP46100 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRXP46100 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRXP46100 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms