Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX5P45973 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX5P45973 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX5P45973 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX5P45973 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX5P45973 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX5P45973 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX5P45973 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX5P45973 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX5P45973 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX5P45973 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX5P45973 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX5P45973 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX5P45973 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX5P45973 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX5P45973 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX5P45973 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX5P45973 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX5P45973 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX5P45973 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX5P45973 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX5P45973 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX5P45973 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX5P45973 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX5P45973 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX5P45973 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX5P45973 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX5P45973 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX5P45973 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX5P45973 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBX5P45973 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX5P45973 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX5P45973 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX5P45973 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX5P45973 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX5P45973 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX5P45973 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX5P45973 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX5P45973 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX5P45973 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX5P45973 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX5P45973 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX5P45973 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX5P45973 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX5P45973 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX5P45973 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX5P45973 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX5P45973 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX5P45973 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX5P45973 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX5P45973 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX5P45973 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX5P45973 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX5P45973 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX5P45973 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX5P45973 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX5P45973 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX5P45973 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX5P45973 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX5P45973 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX5P45973 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX5P45973 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX5P45973 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX5P45973 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX5P45973 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX5P45973 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX5P45973 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX5P45973 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX5P45973 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX5P45973 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX5P45973 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX5P45973 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX5P45973 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX5P45973 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX5P45973 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX5P45973 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX5P45973 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX5P45973 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX5P45973 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX5P45973 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX5P45973 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX5P45973 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX5P45973 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX5P45973 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX5P45973 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX5P45973 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX5P45973 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX5P45973 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX5P45973 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX5P45973 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX5P45973 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX5P45973 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms