Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT3P45378 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNT3P45378 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT3P45378 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT3P45378 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNT3P45378 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNT3P45378 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms