Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSR1P43307 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSR1P43307 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSR1P43307 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSR1P43307 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SSR1P43307 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSR1P43307 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSR1P43307 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SSR1P43307 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSR1P43307 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSR1P43307 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSR1P43307 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSR1P43307 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSR1P43307 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSR1P43307 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSR1P43307 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSR1P43307 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSR1P43307 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSR1P43307 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSR1P43307 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSR1P43307 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSR1P43307 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSR1P43307 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSR1P43307 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSR1P43307 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SSR1P43307 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSR1P43307 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSR1P43307 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SSR1P43307 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SSR1P43307 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSR1P43307 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSR1P43307 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSR1P43307 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSR1P43307 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSR1P43307 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSR1P43307 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSR1P43307 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSR1P43307 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSR1P43307 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSR1P43307 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSR1P43307 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSR1P43307 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSR1P43307 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSR1P43307 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSR1P43307 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSR1P43307 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSR1P43307 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSR1P43307 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSR1P43307 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSR1P43307 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SSR1P43307 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSR1P43307 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSR1P43307 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSR1P43307 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSR1P43307 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SSR1P43307 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSR1P43307 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSR1P43307 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSR1P43307 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSR1P43307 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSR1P43307 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSR1P43307 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSR1P43307 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSR1P43307 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSR1P43307 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSR1P43307 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SSR1P43307 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSR1P43307 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSR1P43307 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSR1P43307 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSR1P43307 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSR1P43307 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSR1P43307 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSR1P43307 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSR1P43307 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSR1P43307 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSR1P43307 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSR1P43307 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSR1P43307 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSR1P43307 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSR1P43307 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSR1P43307 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSR1P43307 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSR1P43307 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSR1P43307 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSR1P43307 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSR1P43307 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSR1P43307 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSR1P43307 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSR1P43307 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SSR1P43307 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSR1P43307 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSR1P43307 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSR1P43307 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SSR1P43307 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSR1P43307 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SSR1P43307 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SSR1P43307 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSR1P43307 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSR1P43307 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms