Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGER3P43115 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTGER3P43115 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGER3P43115 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGER3P43115 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms