Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC1A1P43005 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A1P43005 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A1P43005 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A1P43005 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms