Protein–RNA interactions for Protein: P42841

PFS2, Polyadenylation factor subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFS2P42841 URA8YJR103W 1737 nt7.64□□□□□ -1.19
PFS2P42841 PAU15YIR041W 375 nt7.63□□□□□ -1.19
PFS2P42841 ORT1YOR130C 879 nt7.62□□□□□ -1.19
PFS2P42841 SBP1YHL034C 885 nt7.61□□□□□ -1.19
PFS2P42841 ILV2YMR108W 2064 nt7.61□□□□□ -1.19
PFS2P42841 SRM1YGL097W 1449 nt7.61□□□□□ -1.19
PFS2P42841 SAN1YDR143C 1833 nt7.6□□□□□ -1.19
PFS2P42841 POT1YIL160C 1254 nt7.6□□□□□ -1.19
PFS2P42841 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.6□□□□□ -1.19
PFS2P42841 DUR3YHL016C 2208 nt7.6□□□□□ -1.19
PFS2P42841 MDL2YPL270W 2322 nt7.6□□□□□ -1.19
PFS2P42841 MRS4YKR052C 915 nt7.59□□□□□ -1.19
PFS2P42841 TPC1YGR096W 945 nt7.57□□□□□ -1.2
PFS2P42841 ESS1YJR017C 513 nt7.57□□□□□ -1.2
PFS2P42841 snR4snR4 186 nt7.57□□□□□ -1.2
PFS2P42841 BSP1YPR171W 1731 nt7.57□□□□□ -1.2
PFS2P42841 YMR210WYMR210W 1350 nt7.56□□□□□ -1.2
PFS2P42841 TPN1YGL186C 1740 nt7.55□□□□□ -1.2
PFS2P42841 YLR072WYLR072W 2082 nt7.55□□□□□ -1.2
PFS2P42841 GSF2YML048W 1212 nt7.54□□□□□ -1.2
PFS2P42841 LEU2YCL018W 1095 nt7.54□□□□□ -1.2
PFS2P42841 SRP54YPR088C 1626 nt7.53□□□□□ -1.2
PFS2P42841 GTB1YDR221W 2109 nt7.53□□□□□ -1.2
PFS2P42841 FTH1YBR207W 1398 nt7.53□□□□□ -1.2
PFS2P42841 NAM8YHR086W 1572 nt7.53□□□□□ -1.2
PFS2P42841 TUB4YLR212C 1422 nt7.52□□□□□ -1.2
PFS2P42841 DTR1YBR180W 1719 nt7.52□□□□□ -1.2
PFS2P42841 snR86snR86 1004 nt7.52□□□□□ -1.21
PFS2P42841 PAU5YFL020C 369 nt7.52□□□□□ -1.21
PFS2P42841 AAC3YBR085W 924 nt7.52□□□□□ -1.21
PFS2P42841 NIF3YGL221C 867 nt7.51□□□□□ -1.21
PFS2P42841 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.51□□□□□ -1.21
PFS2P42841 GAS1YMR307W 1680 nt7.51□□□□□ -1.21
PFS2P42841 DUS3YLR401C 2007 nt7.51□□□□□ -1.21
PFS2P42841 RFC1YOR217W 2586 nt7.5□□□□□ -1.21
PFS2P42841 APS2YJR058C 444 nt7.49□□□□□ -1.21
PFS2P42841 STP3YLR375W 1032 nt7.49□□□□□ -1.21
PFS2P42841 PGC1YPL206C 966 nt7.49□□□□□ -1.21
PFS2P42841 LEA1YPL213W 717 nt7.49□□□□□ -1.21
PFS2P42841 PTC6YCR079W 1329 nt7.49□□□□□ -1.21
PFS2P42841 REX2YLR059C 810 nt7.48□□□□□ -1.21
PFS2P42841 FIT1YDR534C 1587 nt7.47□□□□□ -1.21
PFS2P42841 ADE16YLR028C 1776 nt7.47□□□□□ -1.21
PFS2P42841 POP2YNR052C 1302 nt7.47□□□□□ -1.21
PFS2P42841 TMS1YDR105C 1422 nt7.46□□□□□ -1.21
PFS2P42841 UFD1YGR048W 1086 nt7.46□□□□□ -1.22
PFS2P42841 YJL009WYJL009W 327 nt7.45□□□□□ -1.22
PFS2P42841 DIA4YHR011W 1341 nt7.45□□□□□ -1.22
PFS2P42841 ABP1YCR088W 1779 nt7.44□□□□□ -1.22
PFS2P42841 YBR232CYBR232C 360 nt7.44□□□□□ -1.22
PFS2P42841 YIL177CYIL177C 5277 nt7.44□□□□□ -1.22
PFS2P42841 GAL2YLR081W 1725 nt7.44□□□□□ -1.22
PFS2P42841 SPE2YOL052C 1191 nt7.43□□□□□ -1.22
PFS2P42841 HIS3YOR202W 663 nt7.43□□□□□ -1.22
PFS2P42841 PAR32YDL173W 888 nt7.42□□□□□ -1.22
PFS2P42841 YPT11YNL304W 1254 nt7.42□□□□□ -1.22
PFS2P42841 KRE1YNL322C 942 nt7.42□□□□□ -1.22
PFS2P42841 NAS2YIL007C 663 nt7.4□□□□□ -1.22
PFS2P42841 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.4□□□□□ -1.23
PFS2P42841 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.4□□□□□ -1.23
PFS2P42841 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.4□□□□□ -1.23
PFS2P42841 LYS20YDL182W 1287 nt7.39□□□□□ -1.23
PFS2P42841 THP3YPR045C 1413 nt7.38□□□□□ -1.23
PFS2P42841 IGD1YFR017C 588 nt7.38□□□□□ -1.23
PFS2P42841 YJR149WYJR149W 1215 nt7.38□□□□□ -1.23
PFS2P42841 YBR056WYBR056W 1506 nt7.37□□□□□ -1.23
PFS2P42841 TOK1YJL093C 2076 nt7.37□□□□□ -1.23
PFS2P42841 MEP1YGR121C 1479 nt7.37□□□□□ -1.23
PFS2P42841 PFS2YNL317W 1398 nt7.37□□□□□ -1.23
PFS2P42841 CDD1YLR245C 429 nt7.37□□□□□ -1.23
PFS2P42841 FSH2YMR222C 672 nt7.37□□□□□ -1.23
PFS2P42841 HSV2YGR223C 1347 nt7.36□□□□□ -1.23
PFS2P42841 MDH2YOL126C 1134 nt7.36□□□□□ -1.23
PFS2P42841 YKR012CYKR012C 378 nt7.35□□□□□ -1.23
PFS2P42841 SEN2YLR105C 1134 nt7.35□□□□□ -1.23
PFS2P42841 BUB2YMR055C 921 nt7.35□□□□□ -1.23
PFS2P42841 NDE2YDL085W 1638 nt7.34□□□□□ -1.24
PFS2P42841 YIR035CYIR035C 765 nt7.33□□□□□ -1.24
PFS2P42841 RSM7YJR113C 744 nt7.33□□□□□ -1.24
PFS2P42841 INO1YJL153C 1602 nt7.32□□□□□ -1.24
PFS2P42841 YNL140CYNL140C 570 nt7.32□□□□□ -1.24
PFS2P42841 TIF3YPR163C 1311 nt7.31□□□□□ -1.24
PFS2P42841 SDS24YBR214W 1584 nt7.31□□□□□ -1.24
PFS2P42841 BUD31YCR063W 474 nt7.3□□□□□ -1.24
PFS2P42841 YJL064WYJL064W 396 nt7.3□□□□□ -1.24
PFS2P42841 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
PFS2P42841 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
PFS2P42841 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
PFS2P42841 VBA3YCL069W 1377 nt7.3□□□□□ -1.24
PFS2P42841 SLM3YDL033C 1254 nt7.29□□□□□ -1.24
PFS2P42841 PHB2YGR231C 933 nt7.29□□□□□ -1.24
PFS2P42841 ADH3YMR083W 1128 nt7.29□□□□□ -1.24
PFS2P42841 LPD1YFL018C 1500 nt7.28□□□□□ -1.24
PFS2P42841 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.28□□□□□ -1.24
PFS2P42841 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.28□□□□□ -1.24
PFS2P42841 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.28□□□□□ -1.24
PFS2P42841 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.28□□□□□ -1.24
PFS2P42841 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.28□□□□□ -1.24
PFS2P42841 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.28□□□□□ -1.24
PFS2P42841 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms