Protein–RNA interactions for Protein: P42677

RPS27, 40S ribosomal protein S27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27P42677 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS27P42677 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS27P42677 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27P42677 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27P42677 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27P42677 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27P42677 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27P42677 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27P42677 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27P42677 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS27P42677 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS27P42677 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27P42677 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27P42677 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27P42677 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27P42677 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27P42677 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS27P42677 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS27P42677 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS27P42677 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS27P42677 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS27P42677 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS27P42677 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS27P42677 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS27P42677 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS27P42677 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS27P42677 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS27P42677 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS27P42677 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS27P42677 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS27P42677 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS27P42677 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS27P42677 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS27P42677 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27P42677 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27P42677 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27P42677 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27P42677 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27P42677 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27P42677 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27P42677 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27P42677 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27P42677 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27P42677 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27P42677 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27P42677 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27P42677 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27P42677 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27P42677 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27P42677 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27P42677 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27P42677 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27P42677 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS27P42677 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS27P42677 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS27P42677 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS27P42677 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27P42677 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27P42677 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27P42677 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27P42677 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27P42677 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27P42677 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27P42677 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27P42677 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27P42677 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27P42677 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27P42677 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27P42677 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27P42677 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27P42677 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27P42677 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27P42677 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27P42677 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27P42677 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27P42677 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27P42677 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27P42677 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27P42677 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27P42677 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27P42677 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27P42677 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27P42677 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27P42677 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27P42677 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27P42677 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27P42677 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27P42677 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27P42677 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27P42677 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27P42677 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27P42677 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27P42677 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27P42677 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27P42677 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27P42677 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27P42677 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27P42677 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27P42677 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27P42677 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms