Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CBP42338 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CBP42338 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CBP42338 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CBP42338 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIK3CBP42338 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms