Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3CAP42336 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CAP42336 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3CAP42336 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3CAP42336 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3CAP42336 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3CAP42336 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms