Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOLR3P41439 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOLR3P41439 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOLR3P41439 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOLR3P41439 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOLR3P41439 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOLR3P41439 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms