Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASRP41180 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASRP41180 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASRP41180 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASRP41180 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASRP41180 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASRP41180 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASRP41180 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASRP41180 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASRP41180 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASRP41180 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASRP41180 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASRP41180 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASRP41180 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASRP41180 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASRP41180 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASRP41180 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASRP41180 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASRP41180 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASRP41180 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASRP41180 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASRP41180 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASRP41180 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASRP41180 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASRP41180 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASRP41180 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASRP41180 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASRP41180 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASRP41180 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASRP41180 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASRP41180 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASRP41180 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASRP41180 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASRP41180 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASRP41180 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASRP41180 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASRP41180 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASRP41180 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASRP41180 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASRP41180 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASRP41180 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASRP41180 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASRP41180 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASRP41180 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASRP41180 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASRP41180 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASRP41180 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASRP41180 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASRP41180 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASRP41180 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASRP41180 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASRP41180 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASRP41180 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASRP41180 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms