Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL1P40616 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL1P40616 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL1P40616 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL1P40616 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARL1P40616 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARL1P40616 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL1P40616 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL1P40616 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL1P40616 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL1P40616 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARL1P40616 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL1P40616 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL1P40616 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL1P40616 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL1P40616 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL1P40616 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL1P40616 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL1P40616 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL1P40616 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL1P40616 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL1P40616 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL1P40616 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL1P40616 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL1P40616 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL1P40616 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL1P40616 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL1P40616 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL1P40616 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL1P40616 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL1P40616 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL1P40616 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL1P40616 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL1P40616 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL1P40616 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL1P40616 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL1P40616 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL1P40616 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL1P40616 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL1P40616 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL1P40616 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL1P40616 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL1P40616 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL1P40616 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL1P40616 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL1P40616 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL1P40616 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL1P40616 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARL1P40616 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL1P40616 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL1P40616 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL1P40616 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL1P40616 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL1P40616 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL1P40616 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL1P40616 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL1P40616 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL1P40616 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL1P40616 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL1P40616 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL1P40616 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL1P40616 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL1P40616 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL1P40616 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL1P40616 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL1P40616 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL1P40616 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL1P40616 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL1P40616 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL1P40616 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL1P40616 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL1P40616 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL1P40616 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL1P40616 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL1P40616 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL1P40616 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL1P40616 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARL1P40616 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARL1P40616 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARL1P40616 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARL1P40616 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARL1P40616 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL1P40616 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL1P40616 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL1P40616 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL1P40616 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL1P40616 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL1P40616 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL1P40616 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL1P40616 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL1P40616 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL1P40616 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL1P40616 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL1P40616 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARL1P40616 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARL1P40616 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL1P40616 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL1P40616 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL1P40616 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARL1P40616 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms