Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYH11P35749 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MYH11P35749 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYH11P35749 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYH11P35749 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYH11P35749 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYH11P35749 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYH11P35749 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYH11P35749 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MYH11P35749 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYH11P35749 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYH11P35749 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYH11P35749 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYH11P35749 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYH11P35749 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYH11P35749 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYH11P35749 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYH11P35749 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYH11P35749 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYH11P35749 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYH11P35749 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYH11P35749 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYH11P35749 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYH11P35749 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYH11P35749 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYH11P35749 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYH11P35749 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYH11P35749 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYH11P35749 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYH11P35749 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYH11P35749 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYH11P35749 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYH11P35749 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYH11P35749 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYH11P35749 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYH11P35749 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYH11P35749 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYH11P35749 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYH11P35749 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MYH11P35749 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYH11P35749 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYH11P35749 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYH11P35749 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYH11P35749 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYH11P35749 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MYH11P35749 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MYH11P35749 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH11P35749 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH11P35749 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH11P35749 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH11P35749 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH11P35749 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH11P35749 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH11P35749 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYH11P35749 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYH11P35749 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYH11P35749 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYH11P35749 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYH11P35749 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYH11P35749 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYH11P35749 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYH11P35749 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYH11P35749 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYH11P35749 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH11P35749 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH11P35749 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH11P35749 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MYH11P35749 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH11P35749 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH11P35749 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH11P35749 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH11P35749 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH11P35749 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH11P35749 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYH11P35749 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYH11P35749 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYH11P35749 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYH11P35749 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MYH11P35749 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYH11P35749 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYH11P35749 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH11P35749 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH11P35749 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH11P35749 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH11P35749 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH11P35749 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH11P35749 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH11P35749 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH11P35749 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH11P35749 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH11P35749 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH11P35749 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH11P35749 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH11P35749 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH11P35749 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH11P35749 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH11P35749 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH11P35749 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH11P35749 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH11P35749 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms