Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCK1P35558 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCK1P35558 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCK1P35558 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCK1P35558 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCK1P35558 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCK1P35558 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCK1P35558 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCK1P35558 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCK1P35558 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PCK1P35558 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCK1P35558 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCK1P35558 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCK1P35558 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCK1P35558 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCK1P35558 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCK1P35558 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCK1P35558 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCK1P35558 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCK1P35558 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCK1P35558 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCK1P35558 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCK1P35558 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCK1P35558 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCK1P35558 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PCK1P35558 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCK1P35558 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCK1P35558 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCK1P35558 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCK1P35558 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCK1P35558 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCK1P35558 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCK1P35558 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCK1P35558 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCK1P35558 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCK1P35558 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCK1P35558 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCK1P35558 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCK1P35558 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCK1P35558 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PCK1P35558 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCK1P35558 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCK1P35558 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCK1P35558 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCK1P35558 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCK1P35558 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCK1P35558 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCK1P35558 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCK1P35558 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCK1P35558 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCK1P35558 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCK1P35558 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCK1P35558 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCK1P35558 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCK1P35558 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCK1P35558 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCK1P35558 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PCK1P35558 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCK1P35558 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCK1P35558 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCK1P35558 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCK1P35558 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCK1P35558 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCK1P35558 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PCK1P35558 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCK1P35558 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCK1P35558 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCK1P35558 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCK1P35558 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCK1P35558 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCK1P35558 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCK1P35558 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCK1P35558 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCK1P35558 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PCK1P35558 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCK1P35558 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PCK1P35558 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCK1P35558 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCK1P35558 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCK1P35558 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCK1P35558 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCK1P35558 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCK1P35558 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCK1P35558 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCK1P35558 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCK1P35558 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCK1P35558 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCK1P35558 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCK1P35558 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCK1P35558 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCK1P35558 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCK1P35558 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCK1P35558 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCK1P35558 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms