Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RFC1P35251 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFC1P35251 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFC1P35251 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFC1P35251 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFC1P35251 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFC1P35251 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFC1P35251 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFC1P35251 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFC1P35251 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFC1P35251 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFC1P35251 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFC1P35251 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFC1P35251 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RFC1P35251 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFC1P35251 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFC1P35251 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFC1P35251 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RFC1P35251 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFC1P35251 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFC1P35251 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC1P35251 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFC1P35251 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC1P35251 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC1P35251 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC1P35251 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC1P35251 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC1P35251 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC1P35251 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC1P35251 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC1P35251 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC1P35251 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC1P35251 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC1P35251 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC1P35251 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFC1P35251 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC1P35251 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RFC1P35251 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFC1P35251 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFC1P35251 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC1P35251 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC1P35251 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC1P35251 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC1P35251 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC1P35251 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC1P35251 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC1P35251 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC1P35251 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC1P35251 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC1P35251 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC1P35251 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC1P35251 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC1P35251 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFC1P35251 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFC1P35251 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFC1P35251 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFC1P35251 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFC1P35251 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC1P35251 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC1P35251 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC1P35251 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC1P35251 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC1P35251 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC1P35251 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC1P35251 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC1P35251 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC1P35251 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC1P35251 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC1P35251 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC1P35251 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC1P35251 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC1P35251 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC1P35251 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC1P35251 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC1P35251 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC1P35251 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC1P35251 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC1P35251 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC1P35251 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC1P35251 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC1P35251 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC1P35251 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC1P35251 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC1P35251 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC1P35251 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC1P35251 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC1P35251 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC1P35251 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC1P35251 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC1P35251 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC1P35251 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC1P35251 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC1P35251 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC1P35251 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC1P35251 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC1P35251 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC1P35251 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC1P35251 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC1P35251 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC1P35251 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms