Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PFN2P35080 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PFN2P35080 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PFN2P35080 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PFN2P35080 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PFN2P35080 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFN2P35080 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFN2P35080 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFN2P35080 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFN2P35080 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFN2P35080 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PFN2P35080 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFN2P35080 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PFN2P35080 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFN2P35080 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFN2P35080 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFN2P35080 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PFN2P35080 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PFN2P35080 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFN2P35080 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFN2P35080 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFN2P35080 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PFN2P35080 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PFN2P35080 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PFN2P35080 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFN2P35080 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFN2P35080 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFN2P35080 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFN2P35080 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFN2P35080 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFN2P35080 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFN2P35080 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFN2P35080 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFN2P35080 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFN2P35080 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFN2P35080 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFN2P35080 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFN2P35080 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFN2P35080 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFN2P35080 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PFN2P35080 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PFN2P35080 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PFN2P35080 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PFN2P35080 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PFN2P35080 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PFN2P35080 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PFN2P35080 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PFN2P35080 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PFN2P35080 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PFN2P35080 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PFN2P35080 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PFN2P35080 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PFN2P35080 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PFN2P35080 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFN2P35080 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFN2P35080 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFN2P35080 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFN2P35080 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PFN2P35080 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFN2P35080 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PFN2P35080 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFN2P35080 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFN2P35080 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFN2P35080 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFN2P35080 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFN2P35080 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFN2P35080 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFN2P35080 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFN2P35080 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFN2P35080 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFN2P35080 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFN2P35080 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFN2P35080 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFN2P35080 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFN2P35080 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFN2P35080 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFN2P35080 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFN2P35080 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFN2P35080 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFN2P35080 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PFN2P35080 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PFN2P35080 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PFN2P35080 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PFN2P35080 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PFN2P35080 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PFN2P35080 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PFN2P35080 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PFN2P35080 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PFN2P35080 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PFN2P35080 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PFN2P35080 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PFN2P35080 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms