Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB4P30926 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB4P30926 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB4P30926 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB4P30926 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms