Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHRNA5P30532 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHRNA5P30532 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHRNA5P30532 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CHRNA5P30532 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHRNA5P30532 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHRNA5P30532 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CHRNA5P30532 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHRNA5P30532 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CHRNA5P30532 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA5P30532 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHRNA5P30532 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHRNA5P30532 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHRNA5P30532 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms