Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SERPINB3P29508 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SERPINB3P29508 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SERPINB3P29508 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINB3P29508 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINB3P29508 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SERPINB3P29508 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms