Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD1P28289 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMOD1P28289 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMOD1P28289 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMOD1P28289 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD1P28289 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD1P28289 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms