Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR1P25024 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR1P25024 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR1P25024 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR1P25024 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR1P25024 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms