Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNE1P24864 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNE1P24864 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNE1P24864 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNE1P24864 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNE1P24864 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms