Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP100P23497 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP100P23497 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP100P23497 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP100P23497 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP100P23497 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP100P23497 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP100P23497 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP100P23497 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SP100P23497 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP100P23497 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP100P23497 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SP100P23497 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SP100P23497 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SP100P23497 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SP100P23497 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SP100P23497 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SP100P23497 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SP100P23497 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SP100P23497 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SP100P23497 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SP100P23497 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SP100P23497 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP100P23497 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP100P23497 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP100P23497 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SP100P23497 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP100P23497 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP100P23497 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP100P23497 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP100P23497 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP100P23497 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP100P23497 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP100P23497 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP100P23497 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SP100P23497 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP100P23497 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP100P23497 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP100P23497 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP100P23497 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP100P23497 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP100P23497 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SP100P23497 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP100P23497 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP100P23497 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP100P23497 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP100P23497 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP100P23497 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SP100P23497 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP100P23497 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP100P23497 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP100P23497 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP100P23497 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP100P23497 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP100P23497 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP100P23497 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP100P23497 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP100P23497 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP100P23497 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP100P23497 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP100P23497 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP100P23497 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP100P23497 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP100P23497 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP100P23497 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP100P23497 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP100P23497 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP100P23497 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP100P23497 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SP100P23497 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SP100P23497 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SP100P23497 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP100P23497 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP100P23497 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP100P23497 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP100P23497 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP100P23497 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP100P23497 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP100P23497 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP100P23497 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP100P23497 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP100P23497 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP100P23497 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP100P23497 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP100P23497 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP100P23497 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SP100P23497 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP100P23497 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP100P23497 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SP100P23497 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP100P23497 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SP100P23497 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP100P23497 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP100P23497 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP100P23497 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP100P23497 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP100P23497 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP100P23497 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP100P23497 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP100P23497 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms