Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPREP23469 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPREP23469 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPREP23469 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPREP23469 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPREP23469 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPREP23469 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPREP23469 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPREP23469 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPREP23469 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPREP23469 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPREP23469 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPREP23469 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPREP23469 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPREP23469 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPREP23469 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPREP23469 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPREP23469 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPREP23469 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPREP23469 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPREP23469 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPREP23469 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPREP23469 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPREP23469 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPREP23469 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPREP23469 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPREP23469 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPREP23469 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPREP23469 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPREP23469 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPREP23469 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPREP23469 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPREP23469 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPREP23469 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPREP23469 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPREP23469 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPREP23469 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPREP23469 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPREP23469 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPREP23469 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPREP23469 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PTPREP23469 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPREP23469 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPREP23469 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPREP23469 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPREP23469 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPREP23469 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPREP23469 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPREP23469 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPREP23469 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPREP23469 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPREP23469 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPREP23469 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPREP23469 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPREP23469 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPREP23469 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPREP23469 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPREP23469 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPREP23469 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPREP23469 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPREP23469 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPREP23469 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPREP23469 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPREP23469 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPREP23469 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPREP23469 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPREP23469 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPREP23469 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPREP23469 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPREP23469 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPREP23469 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPREP23469 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPREP23469 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPREP23469 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPREP23469 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPREP23469 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPREP23469 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPREP23469 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPREP23469 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPREP23469 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPREP23469 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPREP23469 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPREP23469 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPREP23469 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPREP23469 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPREP23469 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPREP23469 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPREP23469 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPREP23469 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPREP23469 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms