Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC1P21796 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VDAC1P21796 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VDAC1P21796 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VDAC1P21796 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC1P21796 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC1P21796 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC1P21796 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC1P21796 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC1P21796 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC1P21796 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC1P21796 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VDAC1P21796 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC1P21796 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC1P21796 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC1P21796 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC1P21796 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC1P21796 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC1P21796 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VDAC1P21796 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VDAC1P21796 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VDAC1P21796 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VDAC1P21796 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VDAC1P21796 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VDAC1P21796 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VDAC1P21796 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VDAC1P21796 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VDAC1P21796 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
VDAC1P21796 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VDAC1P21796 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VDAC1P21796 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms