Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB4AP20338 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB4AP20338 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB4AP20338 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms