Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF4P18848 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF4P18848 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF4P18848 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF4P18848 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF4P18848 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF4P18848 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATF4P18848 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF4P18848 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF4P18848 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF4P18848 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF4P18848 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF4P18848 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF4P18848 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF4P18848 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF4P18848 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF4P18848 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF4P18848 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF4P18848 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF4P18848 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF4P18848 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF4P18848 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF4P18848 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF4P18848 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF4P18848 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF4P18848 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF4P18848 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF4P18848 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATF4P18848 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATF4P18848 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATF4P18848 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF4P18848 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF4P18848 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF4P18848 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF4P18848 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF4P18848 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF4P18848 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF4P18848 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF4P18848 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF4P18848 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF4P18848 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF4P18848 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF4P18848 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF4P18848 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF4P18848 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF4P18848 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF4P18848 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF4P18848 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF4P18848 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF4P18848 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF4P18848 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF4P18848 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF4P18848 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF4P18848 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF4P18848 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF4P18848 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF4P18848 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF4P18848 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF4P18848 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF4P18848 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF4P18848 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF4P18848 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF4P18848 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF4P18848 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATF4P18848 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATF4P18848 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATF4P18848 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATF4P18848 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF4P18848 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF4P18848 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF4P18848 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF4P18848 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATF4P18848 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF4P18848 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF4P18848 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF4P18848 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF4P18848 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF4P18848 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF4P18848 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF4P18848 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF4P18848 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF4P18848 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF4P18848 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF4P18848 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms