Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7P17544 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7P17544 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7P17544 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7P17544 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7P17544 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7P17544 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7P17544 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7P17544 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7P17544 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF7P17544 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF7P17544 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF7P17544 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7P17544 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7P17544 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7P17544 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7P17544 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7P17544 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7P17544 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF7P17544 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF7P17544 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7P17544 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7P17544 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF7P17544 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF7P17544 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF7P17544 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF7P17544 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF7P17544 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF7P17544 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF7P17544 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF7P17544 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF7P17544 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF7P17544 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF7P17544 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF7P17544 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF7P17544 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ATF7P17544 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF7P17544 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF7P17544 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF7P17544 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF7P17544 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF7P17544 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF7P17544 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF7P17544 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF7P17544 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF7P17544 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF7P17544 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF7P17544 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF7P17544 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATF7P17544 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF7P17544 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF7P17544 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF7P17544 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF7P17544 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF7P17544 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF7P17544 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF7P17544 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF7P17544 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF7P17544 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF7P17544 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF7P17544 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF7P17544 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF7P17544 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF7P17544 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF7P17544 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF7P17544 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF7P17544 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF7P17544 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF7P17544 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF7P17544 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF7P17544 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF7P17544 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF7P17544 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF7P17544 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7P17544 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7P17544 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7P17544 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATF7P17544 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF7P17544 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7P17544 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7P17544 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7P17544 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7P17544 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7P17544 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7P17544 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7P17544 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7P17544 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7P17544 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms