Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOT1P17174 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOT1P17174 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOT1P17174 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOT1P17174 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOT1P17174 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOT1P17174 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOT1P17174 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOT1P17174 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GOT1P17174 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOT1P17174 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOT1P17174 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOT1P17174 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOT1P17174 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOT1P17174 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOT1P17174 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOT1P17174 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOT1P17174 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOT1P17174 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOT1P17174 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOT1P17174 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOT1P17174 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOT1P17174 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GOT1P17174 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOT1P17174 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOT1P17174 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GOT1P17174 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOT1P17174 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOT1P17174 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOT1P17174 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOT1P17174 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOT1P17174 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOT1P17174 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOT1P17174 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GOT1P17174 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOT1P17174 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GOT1P17174 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOT1P17174 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOT1P17174 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOT1P17174 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOT1P17174 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOT1P17174 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOT1P17174 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GOT1P17174 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOT1P17174 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOT1P17174 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOT1P17174 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOT1P17174 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOT1P17174 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOT1P17174 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOT1P17174 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOT1P17174 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOT1P17174 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOT1P17174 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOT1P17174 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOT1P17174 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOT1P17174 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOT1P17174 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOT1P17174 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOT1P17174 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOT1P17174 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOT1P17174 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GOT1P17174 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOT1P17174 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOT1P17174 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOT1P17174 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOT1P17174 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOT1P17174 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOT1P17174 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOT1P17174 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOT1P17174 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOT1P17174 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOT1P17174 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOT1P17174 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOT1P17174 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOT1P17174 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOT1P17174 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOT1P17174 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOT1P17174 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOT1P17174 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOT1P17174 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOT1P17174 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOT1P17174 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOT1P17174 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOT1P17174 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOT1P17174 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOT1P17174 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOT1P17174 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOT1P17174 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOT1P17174 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOT1P17174 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOT1P17174 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOT1P17174 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOT1P17174 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOT1P17174 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOT1P17174 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOT1P17174 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GOT1P17174 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOT1P17174 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOT1P17174 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms