Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD46P15529 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD46P15529 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD46P15529 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD46P15529 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD46P15529 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD46P15529 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD46P15529 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD46P15529 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD46P15529 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD46P15529 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD46P15529 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD46P15529 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD46P15529 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD46P15529 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD46P15529 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD46P15529 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD46P15529 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD46P15529 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD46P15529 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD46P15529 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD46P15529 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD46P15529 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD46P15529 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD46P15529 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD46P15529 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD46P15529 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD46P15529 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD46P15529 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD46P15529 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD46P15529 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD46P15529 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD46P15529 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD46P15529 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD46P15529 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD46P15529 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD46P15529 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CD46P15529 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD46P15529 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD46P15529 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD46P15529 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD46P15529 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD46P15529 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD46P15529 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD46P15529 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD46P15529 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD46P15529 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD46P15529 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD46P15529 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD46P15529 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD46P15529 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD46P15529 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD46P15529 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD46P15529 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD46P15529 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD46P15529 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD46P15529 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD46P15529 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD46P15529 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD46P15529 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD46P15529 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD46P15529 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD46P15529 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD46P15529 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD46P15529 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD46P15529 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD46P15529 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD46P15529 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD46P15529 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD46P15529 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD46P15529 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD46P15529 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD46P15529 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD46P15529 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD46P15529 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD46P15529 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD46P15529 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD46P15529 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD46P15529 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD46P15529 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD46P15529 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD46P15529 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD46P15529 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD46P15529 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD46P15529 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD46P15529 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD46P15529 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD46P15529 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms