Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV1P15498 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAV1P15498 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAV1P15498 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAV1P15498 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAV1P15498 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAV1P15498 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAV1P15498 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAV1P15498 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV1P15498 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV1P15498 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV1P15498 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV1P15498 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV1P15498 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV1P15498 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV1P15498 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV1P15498 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV1P15498 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV1P15498 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV1P15498 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV1P15498 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV1P15498 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV1P15498 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV1P15498 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV1P15498 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV1P15498 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV1P15498 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV1P15498 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV1P15498 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV1P15498 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV1P15498 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV1P15498 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV1P15498 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV1P15498 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV1P15498 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV1P15498 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV1P15498 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV1P15498 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV1P15498 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VAV1P15498 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV1P15498 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV1P15498 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV1P15498 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV1P15498 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV1P15498 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV1P15498 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV1P15498 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV1P15498 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV1P15498 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV1P15498 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV1P15498 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV1P15498 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV1P15498 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV1P15498 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV1P15498 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV1P15498 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV1P15498 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV1P15498 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV1P15498 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV1P15498 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV1P15498 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV1P15498 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV1P15498 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV1P15498 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV1P15498 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV1P15498 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV1P15498 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV1P15498 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV1P15498 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV1P15498 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV1P15498 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV1P15498 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV1P15498 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV1P15498 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV1P15498 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV1P15498 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV1P15498 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV1P15498 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV1P15498 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV1P15498 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV1P15498 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAV1P15498 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAV1P15498 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAV1P15498 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAV1P15498 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAV1P15498 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV1P15498 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV1P15498 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV1P15498 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV1P15498 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAV1P15498 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAV1P15498 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VAV1P15498 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAV1P15498 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAV1P15498 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAV1P15498 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAV1P15498 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAV1P15498 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAV1P15498 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV1P15498 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms